在陈云深入探索具体问题的同时，邓小平也全面展开调查研究。1961年上半年，毛泽东的注意力放在对一大二公的人民公社体制的纠偏和规范上，主持制订了《农村人民公社条例修正草案》（又称“农业六十条”），对人民公社原有的体制进行调整。邓小平上半年也主要是遵照毛泽东的指示，调研人民公社体制问题，他4、5月到北京郊区顺义县进行农村调查，调研结束后，在和彭真联名致毛泽东的信中讲了社队规模、粮食征购和余粮分配、供给制、食堂、家庭副业等问题。

在1961年上半年，对于邓小平领导的中央书记处来说，还有一个重要的变化，就是毛泽东开始点名批评书记处的工作。基于对毛泽东批评的回应和对调查研究问题重要性的认识，在由毛泽东主导的农村问题告一段落后，从1961年下半年开始，邓小平领导书记处认真搞调研工作，在工业、文教等领域制订一系列调整的具体规定。当时工业企业秩序混乱，产量大幅下降，指标难以完成，邓小平提出在工业方面也搞一个类似农业方面的条例来。6月17日，他主持书记处决定起草工业条例。同时在7月14日至25日，亲自赴东北调研保鞍钢冶炼设备开工三分之二的措施问题。从8月9日至15日，他主持书记处会议多次讨论修改条例草案，会议讨论并通过《国营工业企业管理工作条例（草案）》（简称“工业70条”）。邓小平在主持制订“工业70条”的过程中，强调以下观点：

（1）以钢为代表的重工业，产量从1800万吨减到1000万吨是个限度。农轻重中“农、轻”是上，“重”是下，但要保证逐步地上，逐步地下。过去“重”一马当先不对，现在不要又在另一方面过分突出，要正确处理农轻重的关系。

（2）企业要实行严格的定员定编，内部不能有多余的非生产人员。这些人员可以分流出去，或由国家包起来开支，赔在明处；或搞集体所有制，实行独立核算，同企业进行等价交换。

（3）群众运动破坏了企业科学的规章制度，群众运动并不等同于党的群众路线。天天开大会、天天贴大字报、万人上山大炼钢铁的错误做法是不合群众路线的，是反动的。

（4）重视技术人员的作用，要大量培养和提拔年轻技术人员。

（5）企业生产指挥权一定要集中在厂长负责制上，企业党组织不干预日常行政事务。等等。与此同时，邓小平还指导制订了《教育部直属高等学校暂行工作条例（草案）》（简称“高教60条”），并在7月26日至8月5日主持中央书记处会议讨论通过。

在制订完上述两个条例后，从10月至年底，邓小平把很大的精力用在主持书记处讨论制订7年计划上。这时为什么要搞7年计划？邓小平从国内外形势作了解释：在国际舆论上造成同赫鲁晓夫作斗争的声势；国内贯彻调整八字方针以来灰溜溜的，气不壮，7年计划就是要鼓气、壮气，给全党全国人民一个信心；适应经济发展的客观要求，统筹各部门的打算，使工农业生产好安排一些。邓小平还就制订7年计划的指导方针作了说明，即：真正按农轻重的顺序，归根到底以重工业为重点，目标是基本上解决吃穿问题及基本上解决日用品问题。接下来，邓小平主持书记处逐个讨论各部门提交的计划大纲，最后确定了《中央转发国家计委党组关于7年——10年计划的综合汇报提纲》。